時珍生于明朝正德13年(公元1518年)，祖父與父親俱是蘄州瀕湖醫生。時珍生性是個藥癡，對科舉毫無興趣，然而父親一再施壓，他才不得不答應赴考。備考期間，時珍邂逅假扮“藥仙”贈醫施藥的冬青，時珍欣賞她的俠骨柔情與藥理知識，兩人互相仰慕。 時珍因揭發考官因奸不遂;及朝廷權貴嚴嵩之子嚴世潘賄賂舞弊的丑聞，從而得罪考官，把他趕出考場，導致憂憤成疾，大病一場，幸被冬青所救。但時珍在昏迷中，卻誤會她是跟他有婚…

冬青自小無父無母，被怪醫小地藏收養女，并教她醫術。冬青“藥仙”的身份，無意中被時珍拆穿，初時，她嬲惱時珍好管閑事，后來，對時珍的醫術超凡及對醫學的熱誠，心感佩服，兩人互生情愫。可惜陰差陽錯下，時珍誤把她當慕榕，救了自己一命，冬青亦把果珍誤作時珍前來提親。冬青惱恨時珍為了對兄長讓愛，不向她問個究竟，便已另娶他人，罵時珍是懦夫，憤然離開傷心之地。后來，冬青重遇時珍，終釋懷助時珍拜小地藏為師。…

龐憲生于官宦之家，父親是錦衣衛副都統。他自幼聰穎過人，是文武雙全，曾經參軍，后來進入太醫院修讀“醫官”(相等于現代的研究生)，是太醫院的高材生，主修外傷骨科，因為做過軍醫，認為醫病如打仗，喜歡把三十六計融匯醫理當中。 在瀕湖龐憲邂逅慕榕，對她一見鐘情，決意于太醫院畢業后，向慕榕提親。太醫院內，憲初看不起時珍，經常挑戰他，后來終于被時珍高超的醫藥技術收服，甘拜時珍為師。憲拜師后，方知慕榕是時…

慕榕出身貴族，自幼父母雙亡，寄居舅父荊王家中。她自小體弱多病，造成多愁善感性格。時珍十四歲中秀才時，慕榕已仰慕其才華，當年父母將自己許配給時珍，慕榕欣喜不已，決志非君不嫁。后來父母去世后，荊王嫌棄時珍三代行醫、地位低微，加上他三次赴考落第，荊王決要退婚，慕榕傷心致極，不嫁此君，情愿削發為妮。這事感動了時珍，答應娶她，慕榕終償心愿，嫁得時珍為妻。慕榕嫁入李家后，洗盡鉛華，重新學習簡樸生活，從中悟出一…

嚴嵩，進士出身，嘉靖年間被擢升為內閣大學士，后來更被委任首輔，位極人臣。嚴嵩能如此平步青云，只因善迎帝意，鼓吹方術，甚得嘉靖信任和重用。他為求進一步鞏固勢力，勾結方士，利用太醫院煉制仙丹，令皇帝沉溺丹藥修道而不能自拔，豈料卻遭初出茅廬的太醫吏目李時珍批評丹藥含有劇毒，多吃必損龍體而多番向皇上進諫。他不甘被破壞好事，而對時珍多番打壓，在對方提出修改本草著作時，直斥其離經叛道，甚至不惜羅織罪名，欲毀其…

明朝大臣嚴嵩之子，自幼享盡榮華富貴，錦衣玉食。雖然出身顯赫，卻收買考官企圖作弊考取科舉，豈料被同來應考的李時珍揭破，世藩為求脫身反指時珍作弊，其后更藉其父身份進朝為官，任侍郎一職。 當其父與李時珍為著皇上煉丹修道一事爭持不下時，世藩欲追求冬青不果，又知冬青深愛時珍，令他對時珍更是恨之入骨，不惜向父獻計，羅織罪名卻將時珍鏟除，甚至在時珍逃離太醫院后，率將領追捕。其陰險狡詐比其父實在有過之而無不及，故…